2012年1月29日，韩寒经纪人路金波表示，韩寒将以1000页的手稿资料为证据正式起诉方舟子名誉侵权。针对韩寒的诉讼，方舟子很快有了回应，他称欢迎起诉，还特地写下五点声明，表示自己本人不会出庭，但愿意与韩寒在“合适场合”当面对质。他还表示，不管判决结果如何，不会影响他对韩寒文章的继续评判。
韩寒
2012年1月29日，方舟子再发表博文，继续质疑韩寒的文章和说法有多处自相矛盾之处，并坚持认为韩寒早期的文章《书店》《求医》等文章肯定不是韩寒本人所写，怀疑由枪手代写。
2月9日，上海市普陀法院通过微博发布消息，韩寒诉方舟子名誉侵权已正式立案。2月13日上午，上海市普陀区法院官方微博，称韩寒从该院撤诉。
时至今日，该“代笔”事件，依旧没有定论。
